Hathor cattura O'Neill e gli impianta dentro un distruttivo simbionte goa'uld che potrebbe ucciderlo. Intanto, la squadra di salvataggio di O'Neill viene sconfitta dall'invincibile barriera energetica di Hathor. O'Neill verrà salvato in tempo?

L'SG-1 va sulla Terra a caccia di un signore goa'uld e trova l'alieno travestito da leader religioso e con un seguito armato. O'Neill affronta gli agenti del governo e i membri della setta in uno scontro che potrebbe essere letale per tutti.

O'Neill (Richard Dean Anderson) tenta di fermare una massiccia invasione goa'uld sulla Terra, ma per farlo i signori goa'uld chiedono la distruzione dello Stargate. O'Neill non si fida completamente di loro, ma il destino della Terra è in pericolo.

Una misteriosa tavoletta scoperta su un pianeta lontano infonde un allucinogeno in chiunque la tocchi. La pietra infetta Teal'c e, in breve tempo, l'intera squadra tranne Hammond (Don S. Davis). Riuscirà Hammond a salvare l'SG-1 da solo?

Nel corso di un programma di scambio con il pianeta Orban, O'Neill si reca sulla Terra con una ragazzina che ha incredibili conoscenze tecniche. Ma quando O'Neill scopre la verità dietro alla mente superiore della ragazza forse è tardi per tutti.

Le versioni alternative di Carter (Amanda Tapping) e Kawalsky (Jay Acovone) si trovano nell'Area 51. Portati al Comando Stargate, iniziano a deteriorarsi, ma tornare alla loro realtà sarebbe peggio, dato che il loro mondo è stato invaso dai goa'uld!

L'SG-1 viene catturata da Aris Boch, cacciatore di taglie che dà la caccia a Kel'tar, un malvagio goa'uld. L'SG-1 accetta di aiutare Aris in cambio della libertà, ma scopre che Kel'tar è un tok'ra la cui cattura metterebbe in pericolo molti altri.

L'SG-1 si imbatte in una civiltà medievale e libera una donna legata a un palo come sacrificio per un demone. Dopo la liberazione, il demone promette di distruggere il villaggio a meno che la squadra dell'SG-1 non venga offerta come segno di pace.

L'SG-1 si trova in mezzo a uno scontro tra dei soldati dello Stargate e alcuni jaffa. Credendo che i soldati siano la squadra SG-11 dispersa, O'Neill e gli altri li aiutano, finché il misterioso esercito non punta le armi contro l'SG-1!

Durante il salvataggio di alcuni abydoniani in prigionia, Daniel trova la moglie scomparsa, Sha're. Ma anziché salutarlo, lei lo attacca e Teal'c la uccide. Sconcertato dalla sua morte e arrabbiato con Teal'c, Daniel abbandona il Comando Stargate.

L'SG-1 si imbatte in un intero pianeta che soffre di amnesia. La leader del pianeta, Ke'ra, torna sulla Terra con l'SG-1 per trovare una cura. Ma mentre tra Ke'ra e Daniel nasce un'attrazione, l'SG-1 sospetta che Ke'ra non sia come sembra.

Il padre di Carter è stato catturato su una luna trasformata in un inferno. Solo Jolinar è fuggita dall'inferno, perciò viene utilizzata una tecnologia tok'ra per accedere ai ricordi di Jolinar dalla mente di Carter, ma la missione è a rischio!

Durante un tentativo di salvataggio, l'SG-1 viene catturata da un abitante dell'inferno deciso a usare le informazioni dell'SG-1 per sconfiggere il signore dei goa'uld, Sokar. Il team deve rivivere dei ricordi dolorosi, ma quanto potrà resistere?

Durante un esame medico di routine, la dr.ssa Fraiser somministra un sedativo a tutto il team. Teal'c si sveglia e vede il gen. Hammond cospirare con Fraiser e due alieni. Cos'è successo al Comando Stargate? L'SG-1 sconfiggerà i suoi "alleati"?

L'SG-1 viene invitata alla cerimonia della "Triade" sul pianeta Tollan, ma scopre che in realtà è un processo per decidere il destino dell'amico Skaara. Daniel e O'Neill si scontreranno in tribunale con un misterioso goa'uld per difendere Skaara.

Mentre fa rotta verso un pianeta, nel team SG-1 viene impiantata una spora aliena che si evolve in un essere chiamato Urgo. Sebbene Urgo si dichiari amichevole, i membri del team tentano di liberarsi di lui prima che distrugga le loro menti.

L'SG-1 visita il pianeta Edora e osserva la pioggia di meteoriti che illumina il cielo come una pioggia infuocata. Ma degli asteroidi ribelli bombardano il pianeta, distruggendo lo Stargate. O'Neill e il suo team riusciranno mai a tornare a casa?

In missione su Tollan, O'Neill ruba un'arma e la riporta sulla Terra. Quando Hammond scopre l'inganno, sospende O'Neill. Ma la cattiva condotta di O'Neill è solo l'inizio di un profondo mistero che potrebbe avere conseguenze catastrofiche.

L'arrivo dell'SG-1 su un pianeta scatena uno scontro tra due culture. Una spia capisce che la sua fazione potrebbe vincere la guerra se l'SG-1 e lo Stargate verranno neutralizzati. O'Neill e il team lo capiranno e si metteranno in salvo in tempo?

Bra'tac (Tony Amendola) arriva al Comando Stargate con un'incredibile storia sulla guerra interplanetaria contro Apophis (Peter Williams). Daniel deduce che il motivo della guerra è il figlio di Apophis e prova a salvarlo prima che lo trovi Apophis.

Daniel trova un teschio di cristallo uguale a quello scoperto tempo prima da suo nonno. Daniel fissa gli occhi del cranio e una forza lo fa scomparire. Ora l'SG-1 deve trovare suo nonno per scoprire il mistero del cranio e riportare Daniel a casa.

O'Neill viene rapito dagli asgard e si imbatte in uno sciame di insetti metallici che vogliono distruggere la Terra. O'Neill vuole far saltare in aria la nave e sacrificarsi, ma il team troverà un altro modo per evitare questo scenario apocalittico?